职位概述:
塞达斯-西奈医疗中心的梅耶实验室正在寻找一名研究生物信息学家,从事与蛋白质组信息学、质谱、代谢组学、多组学数据整合、单细胞转录组学、单细胞基因组学、单细胞蛋白质组学、计算药物发现和/或化学信息学相关的项目。我们欢迎不同教育水平的候选人,至少要求具有硕士学位。具备机器学习、深度学习、统计学和组学数据分析技能的候选人将优先考虑。理想的候选人应精通Python,并具有使用PyTorch或TensorFlow、Scikit-Learn、Pandas、NumPy和Seaborn的实际经验。具备R语言经验者优先考虑。候选人应通过公共GitHub项目和/或合著的论文证明对这些领域的了解。表现出独立性和渴望了解事物运作方式的候选人将优先考虑。
在密切监督下,研究生物信息学家I进行一般的生物信息学分析和项目中的软件支持,涉及组学。RBI将管理组学数据,包括从数据库系统和公共存储库加载和查询数据,并将多级组学数据转换和合并为用户友好的格式,协助开发、测试和维护模块化软件流水线,提供每日生物信息学数据分析、数据的初步解释和可能发表的结果报告。研究生物信息学家I还进行新的数据分析方法研究。预计生物信息学家将主导项目,并与PI密切合作进行协作项目。成功的候选人将被要求主导论文撰写并发表研究结果。
主要职责:
• 为组学项目提供一般的生物信息学分析支持,主要负责数据分析和软件编译,包括下一代序列比对、多态性鉴定、表达分析和可视化工具和浏览器。
• 将数据分析结果总结为适合作为书面报告初稿基础的形式,并对数据进行初步解释。
• 协助开发、测试和维护基因组测序、组装、注释、宏基因组分析和高通量测序平台(包括454、Illumina和Pacific Biosciences)的基因分型模块化软件流水线。
• 管理数据,包括从数据库系统加载和查询数据,从公共存储库下载组学数据,并将数据转换为必要的格式。
• 通过审查生物信息学和计算生物学相关的文献,帮助识别、评估和整合相关的算法和软件流水线。
教育要求:
计算机科学、电子工程、计算生物学、生物信息学或相关领域的学士学位,或具备强大的定量训练的生物学、生物统计学专业的硕士学位。
执照:无
经验要求:
在研究环境中有0-3年的经验。具备算法、科学计算和机器学习或统计学的背景和工作知识,熟悉C/C++、Java、Perl、Python和Unix(Linux)环境,有操作、分析和注释非常大的基因组(例如NGS)数据集的经验,无论是探索性还是流水线方式,都将是一个加分项。
体力需求:
坐着、站着、走动
工作职称:研究生物信息学家I - 梅耶实验室
部门:计算生物医学
商业实体:塞达斯-西奈医疗中心
职位类别:学术/研究
职位专业:生物信息学
职位类型:全职
班次长度:8小时班次
班次类型:白班
基本工资:71,300.00美元 - 121,000.00美元