我们正在寻找一位热情而有才华的(NLP)数据科学家加入新启动的AI知识管理项目,初期为期3年。这个职位将位于化学生物学服务团队,该团队还开发和提供几个全球公认的资源,包括ChEMBL、ChEBI、SureChEMBL和UniChem。我们特别关注将人工智能和机器学习应用于研究文献,以挖掘与药物发现相关的其他类型的实体,这些实体目前在OT(例如变体、生物标志物、组织/细胞类型、不良事件和测定条件)中尚不可用。这个职位提供了一个真正的机会,在药物发现的关键问题上对OT平台的许多用户产生重大影响,并有机会为与生物学和药物发现实体相关的开源模型和代码做出贡献。
您将加入一个多学科项目团队,该团队还包括机器学习数据专家和数据科学家/工程师。您需要能够展示与同事合作良好的能力,并与外部合作伙伴合作。您必须具备出色的沟通和人际交往能力,并喜欢在一个刺激的国际环境中工作。
您的角色
• 从开放领域收集基准数据集,作为NLP模型的训练集
• 收集规范、测试原型并提供用于基准测试的工具
• 开发和利用统计上健壮的方法进行数据分析和基准测试
• 与团队其他成员合作,寻找并使用来自公共领域(例如HuggingFace)的合适的预训练NLP模型
• 与团队其他成员合作,重新训练公开可用的NLP模型,以确保其对欧洲PMC中可用的开放科学文献进行了优化,以满足项目的需求。
• 支持团队将当前的实体识别工作流程现代化和扩展,以涵盖与药物发现相关的一系列其他类型的实体
• 支持团队开发新的机器学习、深度学习或NLP协议,以增强策划工作流程
• 分析新提取的实体关系,作为特定用例的一部分(例如,探索它们的科学价值)
• 与OT合作伙伴合作,评估、优先考虑、验证和改进所开发的方法
• 与OT核心团队密切合作,实现数据和工作流程与OT平台的无缝集成
• 通过精心制作的演示文稿和出版物,积极向科学界和利益相关者传播项目的成果
您需要具备
• 生物学、生物医学科学或相关学科的硕士或博士学位
• 熟练掌握至少一种现代编程/脚本语言(例如Python)
• 生物数据策划经验和对生物信息学数据库的了解
• 具备高级大数据预处理、清洗和转换技术的经验,特别是针对文本数据的技术,包括本体论
• 对统计方法及其在数据分析中的应用有良好的理解,并能够使用数据可视化工具和库(如Matplotlib、Seaborn)有效传达数据见解
• 注意细节
• 出色的沟通能力,包括演示和口头表达
• 在团队合作环境中工作的经验
• 能够独立工作,管理时间并按时完成工作
您可能还具备以下经验
• 在药物发现和开发环境中工作的经验
• 熟练使用文本分析方法和/或机器学习任务
• 熟悉版本控制系统(如GitHub)
• 对生物信息学方法(包括系统生物学和遗传学分析)具有知识和实践经验
为什么加入我们
做有意义的事情
在EMBL-EBI,您可以运用自己的才华和热情加速科学进步,解决人类面临的一些重大挑战。EMBL-EBI是欧洲分子生物学实验室的一部分,是全球大型生物数据集的存储、分析和传播的全球领导者。我们为全球研究社区提供访问公开数据库和工具的机会,这对于推进医疗保健、食品安全和生物多样性至关重要。
加入创新文化
我们位于威康基因组园区,与其他知名研究和生物技术机构位于同一地区,周围是美丽的剑桥郡乡村。这是一个高度协作和包容的社区,我们的员工享受轻松的氛围。我们致力于确保员工感到受重视、得到支持,并有能力发挥他们的职业潜力。
享受众多福利
• 财务激励:每月家庭、子女和非居民津贴、年度薪资调整、养老金计划、死亡福利、长期护理、工伤和失业保险
• 灵活的工作安排
• 为您和您的直系家属提供私人医疗保险(包括所有处方药和慷慨的牙科和眼科保险)
• 充裕的休假:每年30天年假,另外还有八个公共假日
• 搬迁套餐,包括安装津贴(如果需要)
• 园区生活:免费班车往返工作,现场图书馆,补贴的健身房和自助餐厅,休闲着装规定,丰富的体育和社交俱乐部活动(园区和远程)
• 家庭福利:现场托儿所,10天儿童病假,慷慨的产假,园区假日俱乐部和每月的家庭和儿童津贴
• 非英国居民福利:免签证、私立学校教育津贴、每两年一次回国旅行的经济支持和每月的非居民津贴。
有关更多详细信息,请参阅我们的员工福利页面。
还有其他需要知道的事情
• 合同期限:这个职位是一个为期3年的项目合同,将于2027年6月到期。
• 国际申请者:我们招聘国际人员,成功的候选人将获得免签证。在我们的国际申请者页面上了解更多信息。
• 多样性与包容性:在EMBL-EBI,我们坚信包容和多样的团队能够获得更高水平的创新和创造性思维。我们鼓励妇女、LGBTQ+和来自各个国籍的个人申请。
• EMBL是DORA的签署方。在我们的招聘过程中,了解我们如何实施研究评估的最佳实践。
• 工作地点:这个角色的基地位于英国剑桥附近的Hinxton。如果您来自海外,您将需要搬迁,并将获得慷慨的搬迁套餐来支持您。
• 如何申请:请通过我们的在线系统提交求职信和简历。面试预计将于3月25日举行。