概述
Sidra Medicine正在寻找一位杰出且高度积极的高级研究科学家,专注于人工智能(AI)和生物信息学,加入由Younes Mokrab教授领导的多哈,卡塔尔的基因组医学和生物医学信息学实验室。
该职位将推动实验室的翻译导向研究,重点研究中东人群的基因组-表型相关性,特别关注翻译神经科学,整合分子、成像和临床内表型,以实现精准诊断、临床管理和治疗的患者分层以及目标识别。这项工作将涉及对大规模、多模式数据集的分析,包括基因组/多组学数据(基于短读和长读)、成像和健康记录,使用最先进的数据科学、生物信息学和统计方法。
高级研究科学家将参与研究设计和执行、科学展示和出版,符合部门的研究计划。他们还将参与实验室管理和研究资助申请,并期望与其他研究人员高效合作,同时为本科生和研究生提供培训和指导。
组织概况
Sidra Medicine是一家最先进的学术医疗中心,按照最高国际标准建造,临床任务专注于为妇女和儿童提供卓越的专业护理。Sidra的战略围绕患者和家庭、健康教育和生物医学发现。Sidra Medicine的研究分支拥有数百名研究人员,涵盖广泛的儿科和母婴健康领域,包括基础、翻译、临床试验和生物医学信息学研究。该分支包括超过10,000平方米的专用研究空间,配备最先进的技术,用于高通量测序、信息学、深度表型、先进成像和生物样本库。
翻译神经科学研究计划是Sidra的一个关键倡议,由Younes Mokrab教授和Ruba Benini博士指导。它作为一个多学科临床和研究努力的培育伞,汇集临床医生、科学家和数据专家,建立关于影响中东人群儿童和年轻人的优先神经疾病的综合知识库。其目标是转变诊断、临床管理和量身定制治疗策略的开发,重点关注癫痫、自闭症、大脑畸形、神经发育和神经肌肉疾病。
主要角色和职责:
• 在科学严谨性、分析技能、效率、人际和沟通方面表现出卓越,严格遵守道德行为、研究诚信和机构治理政策
• 通过严格的研究设计、数据处理和分析推动实验室研究,发表高影响力的科学出版物
• 设计、开发和实施生物信息学和分析管道,以支持跨不同数据类型的研究目标,包括基因组、成像和电子健康记录(EHR)数据
• 领导和参与研究资助申请的准备,并帮助催化新颖的科学想法和研究方向
• 参与实验室管理和初级研究人员和员工的指导
• 与实验室成员、临床合作者和最终用户密切合作,确保翻译相关性
• 在内部会议和国内外会议上就研究进展和成果进行口头报告
• 根据研究活动需要偶尔前往合作机构
• 遵守Sidra Medicine的机构标准和政策
所需经验/资格:
• 相关学科的博士学位,最好是生物信息学、数据科学、计算生物学或计算机科学
• 在编程和算法开发方面有扎实的背景,熟练使用Python、Perl、C/C++或Java,以及使用R进行统计计算
• 在设计、训练、验证和部署用于生物医学应用的机器学习和深度学习模型方面有丰富经验
• 对AI模型架构有扎实的理解,包括监督和无监督学习、集成方法、深度神经网络、卷积和递归架构以及基于变换器的模型,适用于生物、成像和多模式数据
• 熟练使用机器学习和深度学习框架(如PyTorch、TensorFlow、Keras、scikit-learn)
• 熟悉模型评估、可解释性、可重复性和偏差评估,特别是在临床或翻译研究背景下
• 在大规模、多组学、成像和临床数据集上应用AI和统计模型的经验
• 熟悉基于Linux的环境、shell脚本(如bash)和高性能或云计算基础设施
• 具有关系数据库、SQL和结构化数据格式的工作经验
• 在高通量生物医学数据分析中应用既定计算方法的经验,包括下一代测序技术(如Illumina、PacBio、Oxford Nanopore)和医学或人类成像
• 具有Web编程经验(PHP、JavaScript、JSON、RESTful API)者优先
• 在高影响力、同行评审的期刊上发表文章和在国际科学会议上发表演讲的强大记录
• 在科学方法论方面有扎实的基础,具有对文献和数据进行批判性评估的高能力,并能快速获得新技能
• 具有优秀的书面和口头沟通能力,能够在多学科团队中有效合作
• 在临床研究实验室、医院附属机构或生物技术/制药行业的经验是一个优势
• 流利的英语书写和口语能力
如何申请:
有兴趣的申请者应将他们的简历、个人陈述(最多一页)以及三位推荐人的姓名和联系方式发送至View email address on nature.com,收件人是Radi Farhad先生,主题为:
SIDRA-12-2025 高级研究科学家 – 生物信息学和人工智能